Lorsqu’il est cultivé comme engrais vert, le seigle prévient le lessivage de façon efficace, protège le sol de l’érosion éolienne et hydrique et bonifie la structure du sol. On le sème sur toute parcelle libre. Le Guide de gestion globale de la ferme maraîchère biologique et diversifiée* met toutefois en garde contre un semis trop rapide suivant la destruction du seigle : « Selon les observations sur le terrain, le seigle qui est détruit au printemps semble avoir un effet allélopathique sur le maïs. Il est donc fort probable que cet effet existe aussi pour certains légumes. »